广州深度测序诊断

人类的病毒性传染很普遍，病毒可以通过呼吸道、消化道、皮肤等多种途径进行传播，常常会导致严重的公共健康问题，对人类的健康造成威胁。传统的病毒检测方法主要依赖于细胞培养法、抗原抗体结合法等，这些方法耗时久，灵敏度低，往往不能够满足临床检测需求。随着分子生物学的发展，PCR方法用于病毒检测的案例越来越多，但该方法的特异性限制了其同时检测其它病毒的能力。因此，需要通过新的技术来实现。随着二代测序技术成本的降低与普及，二代测序在临床病原体检测方面的优势也越加突显。该技术基于二代测序平台，可以直接从样本中获得病原体的核酸序列信息，再通过生物信息学的方法对得到的序列进行分析，可以快速地对样本中可能存在的全部病原体进行鉴定，缩短了临床检测的周期。病毒全基因组测序具有的特点:独有的一定定量技术,实现病原定量分析。广州深度测序诊断

病毒全基因组测序定：探普生物对病毒的全基因组进行测序的实验基于二代测序技术。样本经过核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这3大基本流程后转换成了序列数据。先，在核酸纯化环节，探普提供专门针对性的核酸纯化样本指南，以提高目的物种的核酸纯度和得率，与此同时探普生物也提供核酸纯化服务。第二，文库构建环节，样本的核酸具备浓度低，总量少的特点。探普生物专门针对这一点开发了超微量核酸文库构建，可以将0.01ng/μl甚至更低浓度的核酸构建成测序文库。第三，生物信息学分析环节。生存环境和状态决定了对病毒的全基因组进行测序的下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，搭载了专门用的的生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。

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病毒全基因组测序定在探普生物长时间运行过程中，我们接触到的对病毒的全基因组进行测序项目有比较丰富的应用场景。先，从事基因进化/疫苗/药品/抗体研制方向的研究的研究者一定会用到测序。这种场景一般是用密集的sanger测序监测某几个关键基因，搭载一定频率的全基因组测序。这样的组合省时省力省经费，同时能达到研究目的。此外，有的单位需要对传染病的病原进行流行病学监测和研究，如疾控/疫控中心、医院的传染病科室以及一些高校和研究所的相应课题组，可能需要对病毒的全基因组进行测序以后，结合其他上下游的研究数据，达到研究或者监测疫病的目的。

对病毒的全基因组进行测序时，生物信息学分析是如何进行的？生存环境和状态决定了对病毒的全基因组进行测序的下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，搭载了的生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，专门搭载了生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。生物信息学流程主要包括对非目标数据进行去除以及对目标序列进行筛选，高质量高完整度的序列拼接以及后续的高级分析，如SNP分析，进化分析，耐药位点分析等。在探普的流程下，可以获得完整性很高的基因组序列。

高通量测序技术正式启用之后,研究者可以将样品处理至标准浓度和体积后进行测序和分析。

对病毒的全基因组进行测序费用合理，上海探普生物科技有限公司致力于医药、保养，以科技创新实现管理的追求。探普生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队，以高度的专注和执着为客户提供病毒测序，病毒全基因组测序，病毒宏基因组测序，未知病原鉴定。探普生物继续坚定不移地走高质量发展道路，既要实现基本面稳定增长，又要聚焦关键领域，实现转型再突破。探普生物始终关注医药、保养市场，以敏锐的市场洞察力，实现与客户的成长共赢。

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探普生物专门针对病毒数据搭载了生物信息学分析流程。广州深度测序诊断

二代测序应用的患者类型的推荐：共识明确指出了二代测序应用的患者类型及使用的时机的意见:对于神经系统急性传染/血流传染/呼吸道传染患者，3天是二代测序使用的时机，在传统方法(常规的生化检查和培养)3天未报阳性且经验性调整无效时，强烈推荐二代测序检测；对疑似病毒传染患者，包括：疑似神经系统病毒传染和病毒性肺炎且病情持续进展的患者，若完善传统PCR检测后依然未获得明确的病原学证据时，强烈推荐二代测序检测。对于疑似局灶性传染患者完成常规的生物化学、培养或PCR检测后，若未能获取病原学诊断结果，推荐将二代测序作为检测方法。而对于怀疑继发性血流传染患者：在原发传染灶的病原学检测为阴性或因各种因素无法送检合适标本的情况下，可考虑将血标本的二代测序检测作为二线检测。

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